Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U595 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U595 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U595 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U595 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U595 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U595 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U595 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U595 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U595 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U595 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U595 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U595 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q3U595 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q3U595 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U595 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U595 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U595 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U595 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U595 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U595 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U595 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U595 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U595 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U595 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U595 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U595 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U595 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U595 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U595 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U595 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U595 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U595 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U595 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U595 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U595 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q3U595 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q3U595 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q3U595 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U595 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U595 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U595 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U595 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U595 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U595 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U595 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U595 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U595 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U595 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U595 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U595 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U595 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U595 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U595 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U595 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U595 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U595 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U595 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U595 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U595 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U595 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U595 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U595 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U595 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U595 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U595 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q3U595 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U595 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U595 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U595 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U595 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U595 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U595 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U595 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U595 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U595 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U595 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U595 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U595 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U595 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U595 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U595 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U595 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U595 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U595 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U595 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U595 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U595 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U595 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U595 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U595 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms