Protein–RNA interactions for Protein: Q3U492

Kcp, Kielin/chordin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KcpQ3U492 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KcpQ3U492 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KcpQ3U492 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KcpQ3U492 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KcpQ3U492 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KcpQ3U492 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KcpQ3U492 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KcpQ3U492 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KcpQ3U492 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KcpQ3U492 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KcpQ3U492 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KcpQ3U492 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KcpQ3U492 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KcpQ3U492 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KcpQ3U492 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms