Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9V6

Gm21370, Predicted gene, 21188, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21370Q3T9V6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21370Q3T9V6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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Gm21370Q3T9V6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm21370Q3T9V6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21370Q3T9V6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms