Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms