Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpusd2Q149F1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpusd2Q149F1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpusd2Q149F1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpusd2Q149F1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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