Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN3Q13033 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRN3Q13033 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRN3Q13033 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRN3Q13033 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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