Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YPL067CYPL067C 597 nt7.04□□□□□ -1.28
UBX3Q12229 YER137CYER137C 447 nt7.03□□□□□ -1.28
UBX3Q12229 LOT6YLR011W 576 nt7.03□□□□□ -1.28
UBX3Q12229 PTH2YBL057C 627 nt7.03□□□□□ -1.28
UBX3Q12229 YPQ1YOL092W 927 nt7.03□□□□□ -1.28
UBX3Q12229 MBF1YOR298C-A 456 nt7.03□□□□□ -1.28
UBX3Q12229 NUP84YDL116W 2181 nt7.03□□□□□ -1.28
UBX3Q12229 YML079WYML079W 606 nt7.02□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 DPM1YPR183W 804 nt7.02□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 SDH8YBR269C 417 nt7.02□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 NFS1YCL017C 1494 nt7.01□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 PHO85YPL031C 918 nt7.01□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.01□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 POB3YML069W 1659 nt7□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 PUP2YGR253C 783 nt7□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 CYS3YAL012W 1185 nt7□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 SUN4YNL066W 1263 nt7□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 MHP1YJL042W 4197 nt7□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 SGV1YPR161C 1974 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 YPQ2YDR352W 954 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 PDA1YER178W 1263 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 AQR1YNL065W 1761 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 YBL111CYBL111C 2004 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 HAL5YJL165C 2568 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 RPL43AYPR043W 279 nt6.98□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 NAF1YNL124W 1479 nt6.98□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 DAL7YIR031C 1665 nt6.97□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 PRE5YMR314W 705 nt6.97□□□□□ -1.29
UBX3Q12229 BIM1YER016W 1035 nt6.96□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 RPR1RPR1 369 nt6.96□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 ARO7YPR060C 771 nt6.96□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YPR130CYPR130C 408 nt6.96□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 BNA3YJL060W 1335 nt6.96□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.95□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YPL041CYPL041C 624 nt6.95□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 CTA1YDR256C 1548 nt6.95□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 DML1YMR211W 1428 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YCR049CYCR049C 447 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 PRS4YBL068W 981 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 CST26YBR042C 1194 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YPR127WYPR127W 1038 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 snR30snR30 606 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 MPE1YKL059C 1326 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YCR041WYCR041W 333 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 THR1YHR025W 1074 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 TRR2YHR106W 1029 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 DPH5YLR172C 903 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 PLB2YMR006C 2121 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YOR300WYOR300W 309 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 TUB1YML085C 1344 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 SNF4YGL115W 969 nt6.92□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YLR112WYLR112W 420 nt6.92□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.92□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 GET4YOR164C 939 nt6.92□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 MFG1YDL233W 1377 nt6.92□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 TDP1YBR223C 1635 nt6.91□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 HPT1YDR399W 666 nt6.91□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YAL045CYAL045C 309 nt6.91□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YOR012WYOR012W 414 nt6.91□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 YCL049CYCL049C 939 nt6.91□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 RFS1YBR052C 633 nt6.9□□□□□ -1.3
UBX3Q12229 MSG5YNL053W 1470 nt6.9□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 BRN1YBL097W 2265 nt6.89□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 IRC5YFR038W 2562 nt6.89□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 LAT1YNL071W 1449 nt6.89□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 CIA1YDR267C 993 nt6.87□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 YHC3YJL059W 1227 nt6.87□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 MIX17YMR002W 471 nt6.87□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 DLD1YDL174C 1764 nt6.87□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 YEN1YER041W 2280 nt6.87□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 PMA2YPL036W 2844 nt6.86□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 YOX1YML027W 1158 nt6.86□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 HTZ1YOL012C 405 nt6.85□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 NTG2YOL043C 1143 nt6.85□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 SMC5YOL034W 3282 nt6.85□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 CIR2YOR356W 1896 nt6.85□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 AIM2YAL049C 741 nt6.84□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 YLR162WYLR162W 357 nt6.84□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 ZIM17YNL310C 525 nt6.84□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 SNT309YPR101W 528 nt6.84□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 APE4YHR113W 1473 nt6.84□□□□□ -1.31
UBX3Q12229 YPL247CYPL247C 1572 nt6.83□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 CEM1YER061C 1329 nt6.83□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 GGC1YDL198C 903 nt6.83□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.83□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 YNR005CYNR005C 405 nt6.83□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 FRT1YOR324C 1809 nt6.83□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 AMN1YBR158W 1650 nt6.82□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 YIP4YGL198W 708 nt6.82□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 PAC10YGR078C 600 nt6.82□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 ATO2YNR002C 849 nt6.82□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 YLL058WYLL058W 1728 nt6.81□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 HHY1YEL059W 309 nt6.81□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 SML1YML058W 315 nt6.81□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 YOL099CYOL099C 492 nt6.81□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 ATG22YCL038C 1587 nt6.81□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 AIM46YHR199C 933 nt6.8□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 FCP1YMR277W 2199 nt6.8□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 RBS1YDL189W 1374 nt6.8□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 GPH1YPR160W 2709 nt6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms