Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 BDS1YOL164W 1941 nt6.76□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 RRT14YIL127C 621 nt6.76□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.76□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.76□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.76□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.76□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 IPL1YPL209C 1104 nt6.76□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 TOS1YBR162C 1368 nt6.75□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 SWM1YDR260C 513 nt6.75□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 PAU5YFL020C 369 nt6.75□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 PMU1YKL128C 888 nt6.75□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 MIX17YMR002W 471 nt6.75□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 PPH22YDL188C 1134 nt6.74□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 STE3YKL178C 1413 nt6.74□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 MLS1YNL117W 1665 nt6.74□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 GET2YER083C 858 nt6.73□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 STE4YOR212W 1272 nt6.72□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 PGI1YBR196C 1665 nt6.71□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 YNL295WYNL295W 1575 nt6.71□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 UBP13YBL067C 2244 nt6.71□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 AIM33YML087C 939 nt6.71□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 YMR074CYMR074C 438 nt6.71□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 SLA2YNL243W 2907 nt6.71□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 RAP1YNL216W 2484 nt6.7□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 DLD1YDL174C 1764 nt6.7□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 YGR210CYGR210C 1236 nt6.7□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 INP54YOL065C 1155 nt6.7□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 RIO1YOR119C 1455 nt6.7□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 YIL055CYIL055C 1884 nt6.69□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 DYS1YHR068W 1164 nt6.69□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 YJL144WYJL144W 315 nt6.68□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 YOL099CYOL099C 492 nt6.68□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 RGD2YFL047W 2145 nt6.67□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.67□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.67□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.67□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.67□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.67□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 BIM1YER016W 1035 nt6.67□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 YMR206WYMR206W 942 nt6.67□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 DAL4YIR028W 1908 nt6.67□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 YBR284WYBR284W 2394 nt6.66□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 STP3YLR375W 1032 nt6.66□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 RPS6AYPL090C 711 nt6.66□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 YPL108WYPL108W 507 nt6.66□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 RPS6BYBR181C 711 nt6.66□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 PEX31YGR004W 1389 nt6.66□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.65□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 SER2YGR208W 930 nt6.65□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 NAS6YGR232W 687 nt6.65□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 THR1YHR025W 1074 nt6.65□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 YLR349WYLR349W 507 nt6.65□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 ARG81YML099C 2643 nt6.65□□□□□ -1.34
MSH5Q12175 TUF1YOR187W 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 MSG5YNL053W 1470 nt6.65□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 YCR025CYCR025C 411 nt6.64□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 CUE4YML101C 354 nt6.64□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 PGC1YPL206C 966 nt6.64□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 ADH5YBR145W 1056 nt6.64□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 GEF1YJR040W 2340 nt6.63□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 ERG27YLR100W 1044 nt6.63□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 DPH5YLR172C 903 nt6.63□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 HTS1YPR033C 1641 nt6.63□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 YPR084WYPR084W 1371 nt6.63□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 YLL058WYLL058W 1728 nt6.62□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 PAC2YER007W 1557 nt6.62□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 YPR204WYPR204W 3099 nt6.62□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 CTA1YDR256C 1548 nt6.62□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 CIS3YJL158C 684 nt6.62□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 RPL43AYPR043W 279 nt6.62□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 FCY1YPR062W 477 nt6.62□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 RRP43YCR035C 1185 nt6.61□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 YPT10YBR264C 600 nt6.61□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 CYC8YBR112C 2901 nt6.61□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 HAL5YJL165C 2568 nt6.61□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 NAF1YNL124W 1479 nt6.6□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 RGT2YDL138W 2292 nt6.6□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 IMA5YJL216C 1746 nt6.6□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 QCR6YFR033C 444 nt6.6□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 YPL247CYPL247C 1572 nt6.6□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 GPA1YHR005C 1419 nt6.59□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 ACS1YAL054C 2142 nt6.59□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 SES1YDR023W 1389 nt6.59□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 PET18YCR020C 648 nt6.59□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 YJR107WYJR107W 987 nt6.59□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 GCN3YKR026C 918 nt6.59□□□□□ -1.35
MSH5Q12175 LAG2YOL025W 1983 nt6.58□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 EFT2YDR385W 2529 nt6.58□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 EFT1YOR133W 2529 nt6.58□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 snR82snR82 268 nt6.58□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 PEX13YLR191W 1161 nt6.58□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 ATP2YJR121W 1536 nt6.57□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 PPM1YDR435C 987 nt6.57□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 ICS3YJL077C 396 nt6.57□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 SPS1YDR523C 1473 nt6.57□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 POP1YNL221C 2628 nt6.56□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 TPO3YPR156C 1869 nt6.56□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 HPT1YDR399W 666 nt6.56□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 HIS1YER055C 894 nt6.56□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 YER156CYER156C 1017 nt6.55□□□□□ -1.36
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