Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 COS10YNR075W 1125 nt8.39□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 HOS2YGL194C 1359 nt8.38□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 CDC16YKL022C 2523 nt8.38□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 ERG24YNL280C 1317 nt8.38□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 TPI1YDR050C 747 nt8.38□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 CST26YBR042C 1194 nt8.37□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.37□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.37□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.37□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 YDR327WYDR327W 327 nt8.36□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 HNM1YGL077C 1692 nt8.36□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 MBF1YOR298C-A 456 nt8.35□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 YPL071CYPL071C 471 nt8.35□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 DML1YMR211W 1428 nt8.35□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 YBL113CYBL113C 2379 nt8.35□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 FIT1YDR534C 1587 nt8.35□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 DPH5YLR172C 903 nt8.34□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 OST3YOR085W 1053 nt8.34□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 SCO2YBR024W 906 nt8.34□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 AIM46YHR199C 933 nt8.33□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 DCR2YLR361C 1737 nt8.33□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 SLD7YOR060C 774 nt8.33□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 CIT2YCR005C 1383 nt8.33□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 YPQ2YDR352W 954 nt8.32□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 SHO1YER118C 1104 nt8.32□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 YHC3YJL059W 1227 nt8.32□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 YPL264CYPL264C 1062 nt8.32□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 AFG3YER017C 2286 nt8.32□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 NFS1YCL017C 1494 nt8.32□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 TUB1YML085C 1344 nt8.31□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 ELP3YPL086C 1674 nt8.31□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 PET117YER058W 324 nt8.31□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 DAL7YIR031C 1665 nt8.3□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 URA1YKL216W 945 nt8.3□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 YMR147WYMR147W 672 nt8.3□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 TCB1YOR086C 3561 nt8.3□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 APM1YPL259C 1428 nt8.29□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 GNA1YFL017C 480 nt8.29□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 SIR2YDL042C 1689 nt8.29□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 SRN2YLR119W 642 nt8.28□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 YER152CYER152C 1332 nt8.28□□□□□ -1.08
SSF2Q12153 UFD1YGR048W 1086 nt8.27□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YBR226CYBR226C 411 nt8.27□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YEN1YER041W 2280 nt8.27□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 ATG23YLR431C 1362 nt8.26□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 SUF3tG(CCC)D 72 nt8.26□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 PDA1YER178W 1263 nt8.26□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YLR030WYLR030W 792 nt8.26□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 snR30snR30 606 nt8.26□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 MPE1YKL059C 1326 nt8.26□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 BUD9YGR041W 1644 nt8.25□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YOR041CYOR041C 432 nt8.25□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YPR130CYPR130C 408 nt8.25□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 DPM1YPR183W 804 nt8.25□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 SMC5YOL034W 3282 nt8.25□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 TOP3YLR234W 1971 nt8.24□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 HXT9YJL219W 1704 nt8.24□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 BIM1YER016W 1035 nt8.24□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 RTC4YNL254C 1206 nt8.24□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 CIR2YOR356W 1896 nt8.23□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YGL260WYGL260W 231 nt8.23□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YKL147CYKL147C 618 nt8.23□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 GET4YOR164C 939 nt8.23□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 MCP1YOR228C 909 nt8.23□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 NAF1YNL124W 1479 nt8.23□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 MAL31YBR298C 1845 nt8.22□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 RDR1YOR380W 1641 nt8.22□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YMR074CYMR074C 438 nt8.22□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YNL017CYNL017C 339 nt8.22□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 ZIM17YNL310C 525 nt8.22□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 LIP5YOR196C 1245 nt8.22□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 MSS51YLR203C 1311 nt8.22□□□□□ -1.09
SSF2Q12153 YDR401WYDR401W 564 nt8.21□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 BUR6YER159C 429 nt8.21□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 GTS1YGL181W 1191 nt8.21□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 COS6YGR295C 1146 nt8.21□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 YLR162WYLR162W 357 nt8.21□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 AVO2YMR068W 1281 nt8.21□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 CDC7YDL017W 1524 nt8.2□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 GFA1YKL104C 2154 nt8.2□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 LGE1YPL055C 999 nt8.2□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 DPB2YPR175W 2070 nt8.19□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 RPL43AYPR043W 279 nt8.19□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 SPE3YPR069C 882 nt8.19□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 CIA1YDR267C 993 nt8.18□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 YHR140WYHR140W 720 nt8.18□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 OCA1YNL099C 717 nt8.18□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 CDC23YHR166C 1881 nt8.17□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 PLB2YMR006C 2121 nt8.17□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 DMC1YER179W 1005 nt8.16□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 REV7YIL139C 738 nt8.16□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 YJL144WYJL144W 315 nt8.16□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 SML1YML058W 315 nt8.16□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 AAD14YNL331C 1131 nt8.16□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 PGI1YBR196C 1665 nt8.16□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 YCL049CYCL049C 939 nt8.16□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 RRP46YGR095C 672 nt8.15□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 ERG27YLR100W 1044 nt8.15□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 CWC25YNL245C 540 nt8.15□□□□□ -1.1
SSF2Q12153 ERR3YMR323W 1314 nt8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61 ms