Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hif3aQ0VBL6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hif3aQ0VBL6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hif3aQ0VBL6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms