Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnn2Q08093 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnn2Q08093 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn2Q08093 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms