Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1cQ01815 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1cQ01815 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms