Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col1a2Q01149 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Col1a2Q01149 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col1a2Q01149 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col1a2Q01149 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col1a2Q01149 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms