Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited1P97769 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited1P97769 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cited1P97769 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cited1P97769 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited1P97769 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms