Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Taf1bP97358 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1bP97358 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf1bP97358 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1bP97358 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1bP97358 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms