Protein–RNA interactions for Protein: P63330

Ppp2ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2caP63330 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2caP63330 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2caP63330 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2caP63330 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2caP63330 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2caP63330 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2caP63330 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms