Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX3P56589 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX3P56589 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX3P56589 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX3P56589 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PEX3P56589 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PEX3P56589 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PEX3P56589 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX3P56589 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX3P56589 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX3P56589 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX3P56589 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX3P56589 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX3P56589 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX3P56589 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX3P56589 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX3P56589 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX3P56589 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX3P56589 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX3P56589 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX3P56589 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX3P56589 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX3P56589 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX3P56589 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX3P56589 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX3P56589 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX3P56589 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX3P56589 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PEX3P56589 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PEX3P56589 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PEX3P56589 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PEX3P56589 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PEX3P56589 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PEX3P56589 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PEX3P56589 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PEX3P56589 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PEX3P56589 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PEX3P56589 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PEX3P56589 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX3P56589 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PEX3P56589 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PEX3P56589 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PEX3P56589 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PEX3P56589 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PEX3P56589 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PEX3P56589 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PEX3P56589 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PEX3P56589 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PEX3P56589 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PEX3P56589 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PEX3P56589 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PEX3P56589 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PEX3P56589 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PEX3P56589 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PEX3P56589 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PEX3P56589 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PEX3P56589 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PEX3P56589 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PEX3P56589 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PEX3P56589 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PEX3P56589 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PEX3P56589 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PEX3P56589 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX3P56589 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX3P56589 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX3P56589 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX3P56589 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX3P56589 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX3P56589 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX3P56589 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX3P56589 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX3P56589 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX3P56589 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX3P56589 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX3P56589 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX3P56589 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX3P56589 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX3P56589 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX3P56589 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PEX3P56589 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PEX3P56589 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PEX3P56589 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PEX3P56589 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX3P56589 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX3P56589 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX3P56589 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX3P56589 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX3P56589 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX3P56589 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX3P56589 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX3P56589 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX3P56589 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX3P56589 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX3P56589 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PEX3P56589 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PEX3P56589 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PEX3P56589 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PEX3P56589 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PEX3P56589 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PEX3P56589 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms