Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctbp2P56546 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctbp2P56546 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms