Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrlP54846 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrlP54846 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrlP54846 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NrlP54846 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrlP54846 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrlP54846 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrlP54846 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrlP54846 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NrlP54846 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NrlP54846 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrlP54846 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrlP54846 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrlP54846 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrlP54846 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrlP54846 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrlP54846 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrlP54846 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrlP54846 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrlP54846 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrlP54846 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrlP54846 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrlP54846 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrlP54846 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrlP54846 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NrlP54846 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrlP54846 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrlP54846 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrlP54846 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrlP54846 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NrlP54846 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrlP54846 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrlP54846 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrlP54846 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrlP54846 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrlP54846 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrlP54846 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrlP54846 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrlP54846 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrlP54846 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrlP54846 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrlP54846 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrlP54846 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrlP54846 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrlP54846 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrlP54846 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrlP54846 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrlP54846 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrlP54846 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrlP54846 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrlP54846 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrlP54846 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrlP54846 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrlP54846 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrlP54846 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrlP54846 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrlP54846 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrlP54846 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrlP54846 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrlP54846 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrlP54846 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrlP54846 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NrlP54846 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrlP54846 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrlP54846 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrlP54846 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrlP54846 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrlP54846 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrlP54846 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrlP54846 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrlP54846 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrlP54846 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrlP54846 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrlP54846 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrlP54846 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrlP54846 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NrlP54846 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NrlP54846 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NrlP54846 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NrlP54846 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NrlP54846 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NrlP54846 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NrlP54846 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NrlP54846 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NrlP54846 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NrlP54846 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NrlP54846 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NrlP54846 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NrlP54846 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NrlP54846 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NrlP54846 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NrlP54846 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NrlP54846 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NrlP54846 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NrlP54846 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NrlP54846 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NrlP54846 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NrlP54846 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NrlP54846 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NrlP54846 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms