Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnnt2P50752 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt2P50752 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt2P50752 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt2P50752 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms