Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc19a1P41438 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc19a1P41438 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms