Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighmbp2P40694 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighmbp2P40694 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms