Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oprk1P33534 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Oprk1P33534 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.7 ms