Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PtprmP28828 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PtprmP28828 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PtprmP28828 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprmP28828 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprmP28828 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprmP28828 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PtprmP28828 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprmP28828 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprmP28828 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PtprmP28828 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprmP28828 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprmP28828 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PtprmP28828 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PtprmP28828 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PtprmP28828 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprmP28828 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprmP28828 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprmP28828 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprmP28828 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprmP28828 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprmP28828 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprmP28828 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprmP28828 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprmP28828 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprmP28828 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprmP28828 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprmP28828 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprmP28828 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprmP28828 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprmP28828 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprmP28828 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PtprmP28828 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PtprmP28828 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprmP28828 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprmP28828 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprmP28828 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprmP28828 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprmP28828 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprmP28828 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtprmP28828 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtprmP28828 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtprmP28828 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms