Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col2a1P28481 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col2a1P28481 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col2a1P28481 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col2a1P28481 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Col2a1P28481 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col2a1P28481 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col2a1P28481 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col2a1P28481 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col2a1P28481 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms