Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxd10P28359 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd10P28359 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd10P28359 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd10P28359 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd10P28359 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hoxd10P28359 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxd10P28359 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxd10P28359 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxd10P28359 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxd10P28359 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxd10P28359 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxd10P28359 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxd10P28359 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd10P28359 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd10P28359 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd10P28359 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxd10P28359 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms