Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa5P28312 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa5P28312 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa5P28312 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa5P28312 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa5P28312 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa5P28312 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa5P28312 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa5P28312 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms