Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja1P23242 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja1P23242 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja1P23242 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja1P23242 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja1P23242 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja1P23242 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja1P23242 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja1P23242 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja1P23242 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja1P23242 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja1P23242 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms