Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd48P18181 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd48P18181 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd48P18181 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd48P18181 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd48P18181 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd48P18181 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd48P18181 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd48P18181 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd48P18181 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd48P18181 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd48P18181 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd48P18181 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd48P18181 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd48P18181 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd48P18181 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd48P18181 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd48P18181 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd48P18181 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd48P18181 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd48P18181 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms