Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06323 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06323 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06323 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06323 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06323 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06323 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06323 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06323 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06323 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06323 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06323 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P06323 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06323 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06323 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06323 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06323 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06323 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06323 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06323 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06323 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06323 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06323 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06323 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06323 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06323 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06323 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06323 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06323 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06323 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06323 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06323 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06323 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06323 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06323 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06323 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06323 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06323 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06323 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06323 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06323 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06323 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06323 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06323 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06323 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06323 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06323 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06323 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06323 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06323 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06323 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06323 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06323 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06323 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06323 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06323 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06323 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P06323 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06323 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06323 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06323 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06323 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P06323 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P06323 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06323 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06323 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06323 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06323 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P06323 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06323 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06323 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06323 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06323 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P06323 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06323 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06323 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06323 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06323 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06323 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06323 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06323 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06323 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06323 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06323 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06323 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06323 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06323 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06323 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06323 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06323 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06323 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms