Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxa7P02830 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxa7P02830 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxa7P02830 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Hoxa7P02830 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hoxa7P02830 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms