Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01729 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01729 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01729 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01729 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01729 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01729 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01729 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01729 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01729 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01729 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01729 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01729 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01729 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01729 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01729 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01729 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01729 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01729 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01729 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01729 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01729 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01729 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01729 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01729 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01729 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01729 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01729 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01729 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01729 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01729 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01729 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01729 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01729 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01729 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01729 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01729 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01729 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01729 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01729 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01729 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01729 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01729 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01729 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01729 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01729 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01729 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01729 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01729 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01729 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01729 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01729 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01729 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01729 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01729 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01729 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01729 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01729 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01729 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01729 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01729 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01729 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01729 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01729 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01729 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01729 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01729 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01729 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01729 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01729 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01729 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01729 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01729 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01729 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01729 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01729 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01729 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01729 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01729 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01729 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01729 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01729 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01729 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01729 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01729 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01729 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01729 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01729 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01729 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01729 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01729 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01729 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01729 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01729 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01729 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01729 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01729 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01729 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01729 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01729 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms