Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl20O89093 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl20O89093 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl20O89093 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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