Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
StrnO55106 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
StrnO55106 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
StrnO55106 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
StrnO55106 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
StrnO55106 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
StrnO55106 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StrnO55106 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
StrnO55106 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
StrnO55106 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
StrnO55106 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
StrnO55106 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
StrnO55106 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
StrnO55106 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
StrnO55106 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
StrnO55106 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
StrnO55106 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
StrnO55106 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
StrnO55106 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
StrnO55106 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
StrnO55106 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
StrnO55106 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
StrnO55106 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
StrnO55106 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
StrnO55106 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
StrnO55106 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
StrnO55106 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
StrnO55106 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
StrnO55106 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
StrnO55106 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
StrnO55106 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StrnO55106 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StrnO55106 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StrnO55106 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
StrnO55106 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StrnO55106 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StrnO55106 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
StrnO55106 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
StrnO55106 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
StrnO55106 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
StrnO55106 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
StrnO55106 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
StrnO55106 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
StrnO55106 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
StrnO55106 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
StrnO55106 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
StrnO55106 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
StrnO55106 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
StrnO55106 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
StrnO55106 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
StrnO55106 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
StrnO55106 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
StrnO55106 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
StrnO55106 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
StrnO55106 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
StrnO55106 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
StrnO55106 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
StrnO55106 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
StrnO55106 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
StrnO55106 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
StrnO55106 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
StrnO55106 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
StrnO55106 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
StrnO55106 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
StrnO55106 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
StrnO55106 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
StrnO55106 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
StrnO55106 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
StrnO55106 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
StrnO55106 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
StrnO55106 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
StrnO55106 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
StrnO55106 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
StrnO55106 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
StrnO55106 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
StrnO55106 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
StrnO55106 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
StrnO55106 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
StrnO55106 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
StrnO55106 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
StrnO55106 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
StrnO55106 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
StrnO55106 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
StrnO55106 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
StrnO55106 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
StrnO55106 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
StrnO55106 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
StrnO55106 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
StrnO55106 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
StrnO55106 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
StrnO55106 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
StrnO55106 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
StrnO55106 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
StrnO55106 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
StrnO55106 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
StrnO55106 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
StrnO55106 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
StrnO55106 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
StrnO55106 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
StrnO55106 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms