Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTRA2O43464 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTRA2O43464 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HTRA2O43464 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms