Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk3O35492 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk3O35492 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk3O35492 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk3O35492 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk3O35492 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clk3O35492 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk3O35492 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk3O35492 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk3O35492 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk3O35492 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk3O35492 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk3O35492 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk3O35492 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk3O35492 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk3O35492 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk3O35492 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk3O35492 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk3O35492 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clk3O35492 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk3O35492 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk3O35492 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk3O35492 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clk3O35492 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clk3O35492 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk3O35492 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk3O35492 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk3O35492 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk3O35492 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk3O35492 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk3O35492 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk3O35492 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk3O35492 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk3O35492 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clk3O35492 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk3O35492 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk3O35492 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clk3O35492 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk3O35492 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk3O35492 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk3O35492 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk3O35492 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk3O35492 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk3O35492 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk3O35492 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clk3O35492 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clk3O35492 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms