Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna3O08545 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna3O08545 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna3O08545 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efna3O08545 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Efna3O08545 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efna3O08545 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efna3O08545 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna3O08545 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna3O08545 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna3O08545 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna3O08545 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna3O08545 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna3O08545 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna3O08545 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna3O08545 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna3O08545 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna3O08545 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna3O08545 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna3O08545 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna3O08545 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna3O08545 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms