Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AK157302I3ITR1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AK157302I3ITR1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AK157302I3ITR1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AK157302I3ITR1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AK157302I3ITR1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms