Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LctF8VPT3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LctF8VPT3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LctF8VPT3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LctF8VPT3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LctF8VPT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms