Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd7E9Q9W7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd7E9Q9W7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd7E9Q9W7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms