Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip11E9Q512 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip11E9Q512 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trip11E9Q512 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms