Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Tarbp1E9Q368 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Tarbp1E9Q368 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tarbp1E9Q368 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Tarbp1E9Q368 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Tarbp1E9Q368 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Tarbp1E9Q368 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Tarbp1E9Q368 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms