Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E430018J23RikE9PZQ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms