Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
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Ddx60E9PZQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ddx60E9PZQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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Ddx60E9PZQ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ddx60E9PZQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
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Ddx60E9PZQ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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Ddx60E9PZQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ddx60E9PZQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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Ddx60E9PZQ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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Ddx60E9PZQ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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Ddx60E9PZQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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Ddx60E9PZQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ddx60E9PZQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms