Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap70D3YVL2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cfap70D3YVL2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap70D3YVL2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfap70D3YVL2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap70D3YVL2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms