Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
AU022751B1B0V2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AU022751B1B0V2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
AU022751B1B0V2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
AU022751B1B0V2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
AU022751B1B0V2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AU022751B1B0V2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AU022751B1B0V2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
AU022751B1B0V2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
AU022751B1B0V2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
AU022751B1B0V2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AU022751B1B0V2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AU022751B1B0V2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
AU022751B1B0V2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
AU022751B1B0V2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
AU022751B1B0V2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
AU022751B1B0V2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
AU022751B1B0V2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
AU022751B1B0V2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32■■■□□ 2.71
AU022751B1B0V2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
AU022751B1B0V2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
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