Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms