Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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