Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms