Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB23Q9ULC3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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